Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SEC24AO95486 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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SEC24AO95486 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SEC24AO95486 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SEC24AO95486 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SEC24AO95486 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC24AO95486 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC24AO95486 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC24AO95486 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC24AO95486 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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