Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms