Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Tspan4Q9DCK3 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Tspan4Q9DCK3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Tspan4Q9DCK3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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