Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHMP6Q96FZ7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms