Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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