Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms