Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms