Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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