Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MDH1P40925 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MDH1P40925 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MDH1P40925 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MDH1P40925 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MDH1P40925 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
MDH1P40925 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MDH1P40925 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MDH1P40925 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MDH1P40925 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MDH1P40925 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MDH1P40925 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MDH1P40925 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MDH1P40925 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms