Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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