Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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