Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA2O00451 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms