Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms