Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNPPD1Q9BV87 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CNPPD1Q9BV87 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNPPD1Q9BV87 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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