Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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