Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms