Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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