Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5CP41229 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms