Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RHOP08100 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RHOP08100 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RHOP08100 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms