Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJB4Q9UDY4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms