Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP2Q9P2J9 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms