Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms