Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms