Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC4P56524 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms