Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms