Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCAO15360 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCAO15360 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCAO15360 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FANCAO15360 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FANCAO15360 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FANCAO15360 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FANCAO15360 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FANCAO15360 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCAO15360 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCAO15360 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCAO15360 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCAO15360 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCAO15360 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FANCAO15360 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms