Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms