Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms