Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms