Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
STRN3Q13033 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms