Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms