Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 IL12A-205ENST00000480787 863 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC073578.4-201ENST00000623945 514 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms