Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms