Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms