Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNFSF13BQ9Y275 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF13BQ9Y275 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFSF13BQ9Y275 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms