Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX2Q9UIW0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms