Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl55Q9CZ83 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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