Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX4Q9BYU1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PBX4Q9BYU1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBX4Q9BYU1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PBX4Q9BYU1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX4Q9BYU1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX4Q9BYU1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX4Q9BYU1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX4Q9BYU1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX4Q9BYU1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX4Q9BYU1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms