Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTDSS2Q9BVG9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms