Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms