Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC4A9Q96Q91 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SLC4A9Q96Q91 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms