Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
ABCC11Q96J66 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC11Q96J66 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC11Q96J66 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC11Q96J66 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC11Q96J66 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC11Q96J66 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC11Q96J66 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC11Q96J66 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC11Q96J66 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms