Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN37Q96GY3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN37Q96GY3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms