Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCAF4Q8WV16 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCAF4Q8WV16 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCAF4Q8WV16 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms