Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD1Q8NHV4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms