Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A2

Trpt1, tRNA 2'-phosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpt1Q8K3A2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpt1Q8K3A2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpt1Q8K3A2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms