Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Katnb1Q8BG40 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Katnb1Q8BG40 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms