Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF7Q6Q0C0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms