Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNX4Q63HM2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNX4Q63HM2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNX4Q63HM2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNX4Q63HM2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNX4Q63HM2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNX4Q63HM2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNX4Q63HM2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNX4Q63HM2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNX4Q63HM2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNX4Q63HM2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNX4Q63HM2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCNX4Q63HM2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNX4Q63HM2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.8 ms