Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprnQ60673 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprnQ60673 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms